MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT11

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020250	GGA	2	6	753	758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020250	AAT	2	6	931	936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020250	AAG	2	6	952	957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020250	TAA	2	6	971	976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020250	TAA	2	6	996	1001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020250	AGGA	2	8	1018	1025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020250	TTA	2	6	4804	4809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020250	GATTTT	2	12	4814	4825	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020250	AAT	2	6	4861	4866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020250	GTTT	2	8	4904	4911	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020250	AT	3	6	4939	4944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020250	AAAAT	2	10	4953	4962	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020250	TA	3	6	5002	5007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020250	TGAAA	2	10	5062	5071	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020250	GGA	2	6	6458	6463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020250	TA	3	6	6475	6480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020250	AAGG	2	8	6489	6496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020250	GA	3	6	6826	6831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020250	ATT	2	6	6835	6840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020250	TTCA	2	8	6847	6854	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020250	CTTC	2	8	6907	6914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020250	GTA	2	6	7002	7007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020250	AT	3	6	7052	7057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020250	A	6	6	7102	7107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020250	GTAGC	2	10	7121	7130	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020250	TAC	2	6	7170	7175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020250	GTT	2	6	7215	7220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020250	GTT	2	6	7244	7249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020250	AAG	2	6	7300	7305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020250	T	7	7	8510	8516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020250	TTTA	2	8	8535	8542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020250	AGG	2	6	8585	8590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020250	GTTTG	2	10	8837	8846	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020250	T	6	6	8888	8893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020250	TA	3	6	8902	8907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020250	TAA	2	6	8916	8921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020250	TTATT	2	10	8927	8936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020250	TTAATA	2	12	8954	8965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020250	T	6	6	8982	8987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020250	TTTG	2	8	9556	9563	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020250	TCCCT	2	10	9652	9661	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
42	NC_020250	A	7	7	9703	9709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020250	ATT	2	6	9720	9725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020250	AGG	2	6	9786	9791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020250	GAG	2	6	9840	9845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020250	TA	3	6	9848	9853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020250	CTT	2	6	10140	10145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020250	T	7	7	10148	10154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020250	A	6	6	10167	10172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020250	A	6	6	10178	10183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020250	TATTG	2	10	10206	10215	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020250	A	6	6	11338	11343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020250	AT	3	6	11347	11352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020250	A	7	7	11357	11363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020250	T	7	7	11372	11378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.